1329-1330 yıllarında medreseyi inşa eden kadı Fahreddin bin Muham med Fazlullah’a atfen Fahriye Medresesi olarak isimlendirilmiştir. Hem dinî ilimlerin okutulacağı medrese olarak hem de sufî tekkesi olarak kullanılmıştır. Bir namazgâh ve üç odadan oluşan medrese binasının büyük bölümü 1969 yılında Israil işgal güçleri tara fından yıkılmıştır.